位點特異性的蛋白質光交聯探針已經成為研究活細胞內蛋白質-蛋白質相互作用的關鍵工具。陳鵬課題組長期致力於發展基於遺傳密碼子拓展的蛋白質光交聯技術。在之前的工作中,他們設計了高效光敏感非天然氨基酸交聯探針(DiZPK)🙍🏼♀️,能夠廣泛地用於捕捉活細胞內的蛋白-蛋白相互作用(Nat. Chem. Biol., 2011, 7, 671-677; J. Am. Chem. Soc., 2011, 133, 20581-20587.)。
最近,在上述工作的基礎之上🏒,該課題組發展了“可切割”的新一代光交聯探針DiZSeK(下圖)。與原有探針相比,新一代探針在高效捕捉蛋白相互作用的同時,其骨架中所含的硒原子能夠在過氧化氫氧化條件下斷裂,從而實現對光交聯獲得的“誘餌蛋白-靶標蛋白”復合物的分離🛩。課題組進一步改進了能夠與靶標蛋白上產生的次硒酸基團發生特異反應的捕獲試劑,實現了對靶標蛋白的特異標記和富集★。上述新技術💉,使課題組在後續二維凝膠電泳實驗中有效去除了誘餌蛋白的幹擾,完成了對特定蛋白的全細胞靶標蛋白質譜分析與鑒定🕣。新一代“可切割型”光交聯探針的開發,將有力地推動基於蛋白質光交聯技術的蛋白質組學研究。該工作近日在美國化學會誌上發表(Lin SX, et al, J. Am. Chem. Soc. 2014, DOI10.1021/ja504371w), 並被美國化學會的官方雜誌Chemical & Engineering News以News of the Week的形式進行了報道。 陳鵬實驗室的研究生林世賢是該文第一作者,同時化學與分子工程學院何丹🍇、張帥、生命科學聯合中心龍騰和鳳凰平臺質譜中心孟榮老師為論文的發表做出了重要貢獻🧑⚖️。此項研究得到了國家自然科學基金委🫃、科技部和意昂体育-清華生命科學聯合中心的資助。
DiZSeK